药物与靶标之间的激活/抑制是药物的两种作用机制类型，解析药物-靶标“激活/抑制”作用机制是药物研发的一个重要环节。目前药物和靶标之间的相互作用预测、药物作用的组学分析等算法发展迅速。然而，由于药物作用机制的复杂性和数据稀缺性，如何采用人工智能方法预测药物与靶标的“激活/抑制”作用机制？这一问题尚缺乏有效解决方法，是药物机制预测领域的一个较大挑战。近期，清华大学李梢课题组提出了一个基于多视图深度学习...

近日，科睿唯安（Clarivate Analytics）公布了新一轮ESI（Essential Science Indicators）引用数据分析结果。清华大学北京市中医药交叉研究所所长李梢课题组发表的“TCM network pharmacology: A new trend towards combining computational, experimental and clinical approaches”（“中医药网络药理学：计算、实验与临床相结合的新发展趋势”）一文的被引次数进入全球前0.1%，成为“ESI热点论文（Hot Papers）”，同时也入...

人体是一个由组织、细胞、分子等多层次要素构成的复杂系统。发掘不同组织的细胞构成及其分子特征，解析组织、细胞、分子等多层次要素的系统关联，是阐释人类复杂系统运行机制以及疾病诊疗规律的基础，也是当前生物信息学、系统生物学、网络药理学等新兴学科关注的一个核心科学问题。2019年，李梢教授课题组发表了国际首个胃组织单细胞图谱，率先建立胃炎癌转化单细胞网络，发现前移胃癌早诊时点的胃癌极早期细胞，并实现临床转...

人体是一个由组织、细胞、分子等多层次要素构成的复杂生物系统。理解人体表型和分子的系统关联，是中西医学共同面对的一个根本问题，也是当前生物信息学、系统生物学、网络药理学等新兴学科领域关注的一个重要问题。随着目前单细胞组学等高通量检测技术的快速兴起，如何发展大数据和人工智能方法，突破跨尺度信息融合难题，解析表型与分子之间的多层次关联网络，阐释人体复杂系统运行和疾病诊疗规律，成为研究重点。近期，清华...

本文以胃炎患者为例，收集了35例患者的舌苔和胃液样本，通过宏基因组测序和生物信息学分析，系统构建了舌苔与胃液的微生物图谱，并发现了两个部位之间微生物组的相关性。在物种构成方面，12个门，20个纲，28个目，48个科，72个属和164个种类微生物在舌苔与胃液中均被检测出。其中，在门级别上，放线菌（Actinobacteria）、拟杆菌（Bacteroidetes）、厚壁菌（Firmicutes）、梭杆菌（Fusobacteria）和变形菌（Proteobacteria）等...

名医处方是中医临床经验和智慧的结晶，采用人工智能方法挖掘名医处方经验、进而智能推荐中药处方，成为传承与发扬名医经验的一个重要方向。然而，现有中药处方智能推荐研究往往只利用宏观层次的信息，忽略了病人和处方的微观生物机制，因此难以精准推荐中药处方。如何从宏、微观层次有效地挖掘名医经验，从而智能推荐中药处方，成为一个重要问题。近期，清华大学北京市中医药交叉研究所李梢课题组研制出融合宏、微观信息的中药...